Struttura di una generica Cdk
autore: Dall'Olio Giovanni M.
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La proteina che vedete a fianco è la Cdk2 (in verde e rosa), nella forma attiva, complessata con la ciclina A (in blu).
In vivo, questo complesso è attivo verso la fine della fase G1, e si pensa sia responsabile dell'attivazione della sintesi del DNA, iniziando la replicazione e quindi la fase S.
Ho preso questo complesso come esempio per illustrare i cambiamenti conformazionali indotti dal legame della ciclina con la Cdk.  

Una generica Cdk è composta di due domini:

- Il più piccolo (85 residui) è formato da un foglietto B antiparallelo,ed una singola A-elica.
Questa elica contiene la sequenza di aminoacidi altamente conservata Pro-Ser-Thr-Ala-Ile-Arg, chiamata PSTAIRE: .
Il residuo Glu51 svolge un ruolo fondamentale per l'attività dell'enzima, ma nella forma inattiva è spostato in un posizione scorretta, per cui la Cdk non ha attività catalitica.

- Il secondo dominio è molto più grande (213 residui) ed è essenzialmente formato da A-eliche .
Questo dominio contiene una regione chiamata loop T, che contiene un residuo di Treonina, Thr160, fosforilato nella forma completamente attiva.

L'ATP, cofattore necessario per la reazione di fosforilazione, è posto in una fessura fra questi due domini .